La Red de Bibliotecas Públicas de la Ciudad de México está conformada también por las bibliotecas administradas por dependencias del Gobierno de la Ciudad, las cuales tienen la responsabilidad de difundir los programas y acciones del organismo del cual dependen, contribuir al cumplimiento de sus objetivos y atender a las comunidades específicas que atienden.

Entre ellas encontramos las del DIF, Sistema Penitenciario, Dirección General de Atención Especializada para Adolescentes, Secretaría del Medio Ambiente y Secretaría de Cultura.